La historia de la Iglesia Católica de San José comenzó en 1879 cuando el Reverendo Padre Thomas Hennessy, pastor de la Parroquia Católica de la Anunciación, determinó la necesidad de una iglesia y una escuela en una parte de Houston conocida como Old Sixth Ward. El 2 de octubre de 1879, la Reverenda Madre Gabriel Dillon envió al distrito a varias hermanas de la Orden del Verbo Encarnado y del Santísimo Sacramento para abrir una escuela en Houston Avenue y Kane Street (dos cuadras al sur de Washington Avenue). Las clases comenzaron en una pequeña casa alquilada cerca del sitio actual de la Iglesia de San José.

Para 1880, la matrícula escolar había crecido lo suficiente como para requerir un edificio grande que pudiera servir como escuela e iglesia; así en 1880 se organizó la Parroquia de San José. Los servicios se llevaron a cabo en el edificio de la escuela hasta que estuvo lista una estructura de iglesia con estructura de madera. En 1881, St. Joseph's fue reconocida oficialmente como una parroquia separada con el padre James Grabinger designado como el primer párroco. Durante la estadía de cinco años del padre Grabinger, supervisó la construcción de una capilla.

El padre Anthony Maury reemplazó al padre Grabinger en 1885. Durante su mandato como pastor, el padre Maury supervisó la construcción de la primera rectoría y varias aulas. y en 1893, la escuela y todo su contenido fueron comprados por la parroquia a las hermanas. el padre Maury sirvió hasta 1895 cuando fue sucedido por el padre J. B. Quinlin, el primer jesuita de San José en la parroquia, quien sirvió sólo seis meses.

El padre J. B. Quinlin fue seguido por el padre Thomas Banfield, quien serviría durante los siguientes cuarenta y dos años.

El 8 de septiembre de 1900, el gran huracán de Galveston, comúnmente conocido como "La tormenta de 1900", azotó Houston y destruyó por completo la iglesia de San José. La única parte sobreviviente de la Iglesia fue una estatua del Sagrado Corazón, que se exhibió en el santuario actual, hasta que la estatua fue entregada a otra parroquia en la década de 1970. Debido a la destrucción, una vez más la escuela tuvo que servir como iglesia parroquial.

A medida que se acercaba la tormenta, la campana en el campanario de madera blanca emitió una advertencia. Su cañón roto; apenas sobrevivió a la furia de la tormenta. La campana fue el primer molde en Houston, habiendo sido instalada en la antigua Iglesia de San Vicente de Paul en la esquina de las calles Franklin y Caroline en 1843. Cuando San Vicente cerró en la década de 1870, la campana fue transferida a la Iglesia de la Anunciación. en 1881 la campana fue donada a St. Joseph's

En 1901 se inició la construcción de una nueva iglesia de ladrillos que el padre Banfield quería que fuera "un adorno de la ciudad". En lugar de que se construyera la iglesia en Houston Avenue, donde los sonidos de la ciudad distraían demasiado para los servicios, el padre Banfield hizo construir la nueva iglesia en Kane Street. La actual estructura de ladrillos se completó a finales de 1901, y la piedra angular se colocó el 19 de mayo de 1901. Los bancos del edificio antiguo se recuperaron para la nueva iglesia.

Los planos del edificio fueron realizados por Patrick S. Rabbit, un arquitecto de Galveston empleado por el gobierno de Estados Unidos. Rabbit se formó en la oficina de Nicholas J. Clayton de Galveston y más tarde se convirtió en socio de Clayton. El supervisor de la construcción fue George E. Dickey. La construcción total de la iglesia tomó un año.

El estilo elegido para el edificio fue el románico italiano victoriano con un plan basilicano. Las dimensiones desde el exterior son 53 pies de ancho y 123 pies de largo. El edificio tiene una altura libre de 40 pies desde el piso hasta el techo. Tiene techo a dos aguas de composición, molduras de piedra y obra de ladrillo opus spicatum. Opus Spicatum es una unión ornamental resultante de colocar ladrillos para proyectar diagonalmente desde la cara de la pared en una configuración de dientes de sierra. El estilo románico, particularmente los arcos, le da a la iglesia un carácter rico y distintivo y hace que el edificio en sí sea una de las joyas arquitectónicas de Houston.

La entrada principal consta de un triple juego de puertas dobles. El portal está flanqueado por columnas dobles de piedra corintia. Aunque estas columnas son bastante cortas, sostienen un gran arco de medio punto.

Un gran rosetón se coloca sobre el hastial de entrada construido con arcos escalonados de ladrillo. Cada ventana del triforio lateral y frontal tiene un arco redondo.

El interior de San José contiene numerosos elementos de importancia histórica. El altar principal está hecho de mármol americano adornado con mármol italiano. Este altar fue instalado en marzo de 1910 y fue entregado en memoria de Adam y Frances Clay, la primera familia inscrita en el registro de la iglesia en 1880. El altar fue construido por la Ott Memorial Company de Galveston. El órgano Estey estuvo una vez en exhibición en la Feria Mundial de St. Louis.

El 23 de febrero de 1902, San José se dedicó oficialmente con una ceremonia formal y un discurso del obispo Gallagher de Galveston. Inmediatamente, la Iglesia de San José fue reconocida como un activo arquitectónico para Houston.

Bajo la supervisión del padre Banfield, se construyó una rectoría en 1911 en los terrenos de la parroquia. La rectoría es una casa colonial blanca de dos pisos con amplias terrazas laterales. También se construyó un edificio escolar parroquial en 1922. Este edificio ahora alberga la oficina de la Iglesia.

Durante el mandato del Padre Banfield, St. Joseph's resistió la Depresión de 1929 y permaneció abierto cuando muchas iglesias de Houston tuvieron que cerrar. después de una vida larga y creativa, el padre Banfield murió en septiembre de 1938. Fue sucedido por el reverendo Joseph P. Sullivan y más tarde por el reverendo Lawrence Lee.

Con la muerte del padre Banfield y el carácter cambiante de la ética del vecindario, St. Joseph's experimentó una transformación radical. La membresía de la iglesia disminuyó en las décadas de 1950 y 1960. Y en 1967, St. Joseph's se vio obligado a cerrar su escuela debido a la disminución de la asistencia. la parroquia, enfrentada a numerosos problemas, estaba cerca de la bola de demolición.

Afortunadamente, el padre Maurice Dho, quien siguió como pastor en julio de 1971, puso a la Iglesia en una sólida situación financiera. Además, como el 75. Se acercaba el aniversario de San José, miembros de la congregación, ciudadanos interesados ​​y el Comité de Restauración de San José unieron fuerzas para restaurar la Iglesia en 1974. Durante la restauración, se instaló un mural de la Resurrección y la Compañía de Jesús (Padres Jesuitas ) asumió la responsabilidad de la Iglesia de San José. En 1977, los residentes de St. Joseph y el sexto distrito instituyeron un Festival Multiétnico como un esfuerzo comunitario.

En 1911, se añadió a la Iglesia una serie de hermosos vitrales. El proyecto de la vidriera fue un esfuerzo de un miembro vitalicio de la Iglesia, el Sr. F. A. Heiman. Las ventanas están hechas de vidrio alemán y se combinan perfectamente con otras ventanas de la Iglesia. La Compañía Franz Myer de Munich, Alemania, creó las veinticuatro ventanas conmemorativas.

En 1980, la parroquia de la Iglesia celebró su centenario. Cinco años después, 144 niños, bajo la supervisión de Pio Pulido y Sylvia Orazco, completaron un mural de 34 por 58 pies en el edificio de la escuela. El mural se titula "Una comunidad unida". "Y en 1988, San José encargó al escultor Eric Kaposta que diseñara y construyera una estatua de bronce de tamaño natural de San José. La estatua fue dedicada el 21 de agosto de 1988.

La primera iglesia católica construida al norte de Buffalo Bayou y la segunda parroquia más antigua existente en Houston, hoy en día, St. Joseph's sigue siendo una iglesia católica romana que sirve a una congregación compuesta por miembros de larga data, así como comunidades negras, hispanas y vietnamitas. La parroquia es un centro de actividades comunitarias que incluyen un festival multiétnico de dos días, un centro nutricional para personas mayores, un ministerio de servicios sociales y un programa de colocación laboral. Además, la iglesia patrocina un programa de distribución de alimentos para los pobres y hambrientos de Houston.

St. Joseph's es un modelo de revitalización de iglesias en el centro de la ciudad. Existe no solo como una fuerza vital significativa para la comunidad del centro de la ciudad de Houston, sino que también su interesante trasfondo y su distintivo estilo románico lo convierten en una valiosa contribución a la historia, la cultura y la arquitectura de Houston.

En 1981, la Iglesia de San José fue incluida en el Registro Nacional de Lugares Históricos y en 1988 como Monumento Histórico de Texas.